骨不连的原因可分为三类：技术性因素、生物学因素和联合因素。
1、全身性因素：病人的代谢和营养状况、一般健康状况和活动情况，激素、药物、年龄、性别、人种、营养和其他因素等，例如患者营养不良，体质虚弱或伴随其他消耗性疾病，或术后过早负重活动，或功能锻炼方法不正确等。最近有报道吸烟也可以引起骨不连。
2、技术性因素：主要是由于治疗方法不当引起的。
①、感染使骨折端坏死以及营养血管闭塞，破坏骨痂形成的正常进程，骨质吸收或形成死骨，导致骨不连。
②、治疗不当使骨折端分离；不能消除骨折端不利的异常活动及应力；肌肉收缩力使骨折断端间隙增大，如尺骨鹰嘴骨折，膑骨骨折等。开放性粉碎性骨折清创时过多地去除碎骨片造成骨缺损；骨折间隙嵌有软组织。
③、严重开放性骨折造成软组织损伤，影响骨折端血运，骨不连发生率也较高，可达5%～17%。手术切开复位，因骨膜剥离过多，骨不连发生率可高于闭合复位的4倍。传统的坚强内固定和一期愈合与应力遮挡，钢板下的血运破坏发生率较高，易发生坚强内固定后的骨吸收以及拆除内固定物后的再骨折。
3、生物学因素
有时治疗方法是得当的，骨不连接是由于生物学过程异常造成的，包括骨痂形成障碍、骨痂钙化障碍、异常分化、骨改建塑形异常。 骨折后的软、硬组织损伤具有促进正常骨愈合的作用，称为区域性加速现象(RAP)。临床上某些疾病可使RAP低下，包括糖尿病、合并周围神经损伤、各种原因引起的区域性主要感觉丧失、二磷酸中毒、严重放射性损伤和营养不良等。
有些患者有一项上述因素即可发生骨折愈合缓慢甚至不愈合，最终导致骨不连。更多见的是一个患者身上可能有上述两个以上因素同时存在，因此导致了骨不连的发生
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